Lo ideal sería que esas particiones no aparezcan allí ya que molestan sin aportar nada, a no ser que sea necesario su montaje (y en cuyo caso lo mas sencillo es hacerlo en el arranque mediante /etc/fstab). Voy a contarlo aquí para tenerlo más mano para la próxima vez.
La manera de ocultarlas es editar el siguiente fichero:
# cat /etc/udev/rules.d/10-local.rules
KERNEL=="sda2", ENV{UDISKS_IGNORE}="1"
KERNEL=="sda4", ENV{UDISKS_IGNORE}="1"
KERNEL=="sda5", ENV{UDISKS_IGNORE}="1"
Siendo sda2, sda4 y sda5 las particiones de Windows que queremos ocultar en el ejemplo. En el siguiente reinicio ya no aparecerán tentadoras para el doble click.Para identificar las particiones a ocultar podemos usar, como root, "fdisk -l" para casos normales o "parted /dev/sdX print" si la tabla de particiones está en formato GPT.
Si queremos aplicarlo sobre muchas máquinas lo lógico es poner una regla puppet distribuya /etc/udev/rules.d/10-local.rules a todas ellas.
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